敦克爾聯邦的政治系是三權分治，總統、國會、最高法院互相制衡，另外設有國防部長掌管兵權。原本國防部長下轄八大星將，分管海陸空宇等多個兵種，后來因為遠航軍自系，又推舉了統帥，所以國防部長的權利被削掉一大半，分給了漢尼拔，兩人算是平級，各安其事。
總統掌握著聯邦總的用兵權利，并下設閣分